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在 Debian GNU/Linux 中，GNU 代表"GNU's Not Unix"。GNU 是一个自由操作系统项目，由 Richard Stallman 在 1983 年发起，目标是创建一个类Unix的操作系统，但遵循自由软件的理念。GNU 项目致力于开发自由、开源的软件，以提供用户更多的自由和控制权。
Debian GNU/Linux 发行版结合了 Linux 内核和 GNU 工具集合，形成了完整的操作系统。GNU 提供了大量的用户空间工具和应用程序，使得用户可以在 Linux 内核的基础上运行完整的操作系统环境。因此，Debian GNU/Linux 将 GNU 作为其基础，以强调其自由软件的精神和哲学。
