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在Python中,可以使用scikit-learn库来实现Self-Organizing Maps (SOM)聚类算法。下面是一个示例代码:
from sklearn.cluster import KMeans import numpy as np class SOM: def __init__(self, n_clusters, grid_size, learning_rate=0.2, max_iterations=100): self.n_clusters = n_clusters self.grid_size = grid_size self.learning_rate = learning_rate self.max_iterations = max_iterations def fit(self, X): # 初始化权重矩阵 self.weights = np.random.rand(self.grid_size[0], self.grid_size[1], X.shape[1]) for iteration in range(self.max_iterations): # 随机选择一个样本 sample = X[np.random.choice(X.shape[0])] # 计算最近的聚类中心 bmu = self.find_best_matching_unit(sample) # 更新邻近的权重矩阵 self.update_weights(sample, bmu, iteration) def find_best_matching_unit(self, sample): # 计算每个聚类中心与样本的距离 distances = np.linalg.norm(self.weights - sample, axis=2) # 找到最近的聚类中心 bmu_index = np.unravel_index(np.argmin(distances), distances.shape) return bmu_index def update_weights(self, sample, bmu, iteration): # 计算邻近的权重矩阵范围 radius = self.calculate_radius(iteration) start = np.maximum(0, bmu - radius) end = np.minimum(self.grid_size, bmu + radius + 1) # 更新邻近的权重矩阵 for i in range(start[0], end[0]): for j in range(start[1], end[1]): self.weights[i, j] += self.learning_rate * (sample - self.weights[i, j]) def calculate_radius(self, iteration): # 计算邻近的权重矩阵范围 initial_radius = np.max(self.grid_size) / 2 time_constant = self.max_iterations / np.log(initial_radius) return initial_radius * np.exp(-iteration / time_constant) def predict(self, X): # 计算每个样本所属的聚类中心 distances = np.linalg.norm(self.weights - X[:, np.newaxis, np.newaxis], axis=3) cluster_indices = np.argmin(distances, axis=2) # 使用KMeans算法对聚类中心进行进一步的聚类 kmeans = KMeans(n_clusters=self.n_clusters) kmeans.fit(self.weights.reshape(-1, self.weights.shape[2])) # 根据KMeans算法的聚类结果,将样本分配到最终的聚类中心 return kmeans.predict(self.weights.reshape(-1, self.weights.shape[2]))[cluster_indices] # 示例使用 # 创建一个包含三个聚类中心的SOM模型,并使用iris数据集进行训练和预测 from sklearn.datasets import load_iris iris = load_iris() X = iris.data som = SOM(n_clusters=3, grid_size=(10, 10)) som.fit(X) labels = som.predict(X) print(labels)
上述代码实现了一个简单的SOM聚类算法,使用iris数据集进行了训练和预测。首先,定义了一个SOM类,该类包含了聚类的基本操作,如初始化权重矩阵、计算最近的聚类中心、更新邻近的权重矩阵等。然后,使用fit方法对SOM模型进行训练,使用predict方法对样本进行聚类预测。最后,使用KMeans算法对聚类中心进行进一步的聚类,将样本分配到最终的聚类中心。